yugoさん、こんにちは。
いただいた状況から考えると、以下の点が原因として可能性があると思いますので、調整方法を提案します。
1,kusanagi-wp-plugins が古い可能性
最新バージョンは1.4.1です。
まずは以下で現在のバージョンを確認してみてください。
cat /home/kusanagi/{profile}/DocumentRoot/wp-content/mu-plugins/wp-kusanagi.php
もし古い場合は、次のコマンドで更新できます。
dnf update kusanagi-wp-plugins
kusanagi update plugin {プロファイル名}
2,advanced-cache.phpが古いキャッシュのままになっている可能性
テーマ切り替えや設定変更後、advanced-cache.phpが更新されず、以前の内容が使われ続けてしまうことがあります。
一度、ページキャッシュの画面からキャッシュをクリアして、advanced-cache.phpを再生成して、
最新の状態にしてから確認してみてください。
進展があれば共有してください。