Reply To: bcache on時に「WP_CACHE定数が重複して定義されています」となり失敗します。

fcacheはNGINXのキャッシュでwp-config.phpを利用していないので、bcacheだけがwp-config.phpの書き換えを行いますので、どちらを先にON/OFFしてももちろんどちらかだけを使用していても問題はありませんね。

何らかの操作時か、KUSANAGIのprovision時に定数が設定されなかったか消えてしまったのでしょう。
ないとは思いますが、KUSANAGIの専用プラグイン以外にキャッシュ系のプラグインを入れていたりしませんよね？