cloudy　さん
さっそくの回答ありがとうございます。

コマンド終了後に「echo $?」を実行したところ「0」が返ってきました。
正常終了したものだと認識しました。

ありがとうございます。

再送です。（-fqdn http://www.sample.com が　–fqdn http://http://www.sample.com になっていたため）

お世話になります。

Esxi7.0 で KUSANAGI9を新規にインストールしています。
（3）のSSLの操作でエラーが発生しておりますので、エラーの修正法があればご教示ください。
また無視してよいエラーであればその旨、ご教示いただけますと幸いです。

手順ここから———-
1.KUSANAGIのプロビジョニングでは、後からSSL化を行うため、–noemailで実行しました。
kusanagi provision –wp –wplang ja –fqdn http://www.sample.com –noemail –dbname * –dbuser * –dbpass “*” site

2.WORDPRESSの初期設定を行い、WORDPRESSを初期化しました。
　ページにアクセスできることを確認しました。

3.sslを設定するため、以下コマンドを実行すると「Execution failed」のエラーが発生します。
kusanagi ssl –email sample@gmail.com site
———-ここまで手順

[root@localhost ~]# kusanagi ssl –email sample@gmail.com site

Saving debug log to /var/log/letsencrypt/letsencrypt.log
Account registered.
Requesting a certificate for http://www.sample.com

Successfully received certificate.
Certificate is saved at: /etc/letsencrypt/live/www.sample.com/fullchain.pem
Key is saved at: /etc/letsencrypt/live/www.sample.com/privkey.pem
This certificate expires on 2023-12-09.
These files will be updated when the certificate renews.
Certbot has set up a scheduled task to automatically renew this certificate in the background.

– – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – –
If you like Certbot, please consider supporting our work by:
* Donating to ISRG / Let’s Encrypt: https://letsencrypt.org/donate
* Donating to EFF: https://eff.org/donate-le
– – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – – –

★★★エラー（ここから）
Execution failed: env RENEWED_LINAGE=/etc/letsencrypt/live/www.sample.com /opt/kusanagi/bin/ct-submit.sh
Return code was 1
★★★エラー（ここまで）

ssl email completed.
Auto renewal of certificate enabled.
ssl auto completed.
restart completed.
ssl completed.

以下はステータス情報です。
[root@localhost ~]# kusanagi status

KUSANAGI Version 9.4.0-1.el9
vmware

*** (active) nginx : nginx125 ***
* nginx.service – The NGINX HTTP and reverse proxy server
Loaded: loaded (/usr/lib/systemd/system/nginx.service; enabled; preset: disabled)
Active: active (running) since Sun 2023-09-10 20:28:38 UTC; 2h 7min ago

*** (inactive) httpd : httpd ***
* httpd.service – The Apache HTTP Server
Loaded: loaded (/usr/lib/systemd/system/httpd.service; disabled; preset: disabled)
Active: inactive (dead)

*** (active) php : php74 ***
* php-fpm.service – The PHP FastCGI Process Manager
Loaded: loaded (/usr/lib/systemd/system/php-fpm.service; enabled; preset: disabled)
Active: active (running) since Sat 2023-09-09 21:01:43 UTC; 1 day 1h ago

*** (active) mariadb : mariadb10.5 ***
* mariadb.service – MariaDB 10.5.22 database server
Loaded: loaded (/usr/lib/systemd/system/mariadb.service; enabled; preset: disabled)
Active: active (running) since Sat 2023-09-09 21:02:01 UTC; 1 day 1h ago

*** (inactive) psql : ***

*** (inactive) pgpool-II : ***

*** python ***
Python 3.9.18

*** ruby ***
ruby is not installed.

*** Cache status ***

*** WAF ***
off

*** SELinux ***
off

status completed.
[root@localhost ~]#

調査した結果について、追加の報告です。

■エラー：Warning: Skipping an uninitialized class “GoogleSitemapGeneratorStatus”, replacements might not be complete.
Wordpressの「Google XML Sitemaps」というプラグインに GoogleSitemapGeneratorStatus が含まれています。
私の環境では、このプラグインは使用していないため、無視してもよいと判断しました。
https://gato.intaa.net/archives/50742

■エラー：Warning: Skipping an uninitialized class “FS_Plugin”, replacements might not be complete.
Wordpressの「WP Free SSL」というプラグインにFS_Pluginが含まれています。
私の環境では、このプラグインは使用していないため、無視してもよいと判断しました。
FS_Plugin
https://plugintests.com/plugins/wporg/wp-free-ssl/latest/structure/classes

■確認したいこと
kusanagi でドメイン変更をする際に発生する上記のエラーについて、該当するPlugin を利用しているようであれば注意してね　と判断しました。
私の環境では、上記プラグインをインストールしていないため問題なしという認識です。（一方で、Plugin をインストールしていないのに出力される点が少し引っ掛かります。）
この認識に相違点があれば、ご指摘いただけますと幸いです。