Reply To: kusanagi update cert でエラーが発生し証明書が更新されません

エラーメッセージを見るにvirtualenvがOS標準のものから入れ変わってしまっているんじゃないでしょうか。

type virtualenv
→ /usr/bin/virtualenvですか？
もしそうであれば、PATHを直しましょう。

virtualenv --version
yum info virtualenv
→ この2つのバージョンは一致しますか？
もし一致しなければ、yum reinstall python-virtualenv で入れ直しましょう。