ありがとうございます。
yum update を実行するケース、実行しないケース両方で試行しましたが、同じ現象が発生します。
kusanagi init 自体も、出力を見る限り自動で yum update をかけているように見えます。
> Loaded plugins: fastestmirror
から、
> python-markdown.noarch 0:2.4.1-1.el7.centos rdma.noarch 0:7.3_4.7_rc2-6.el7_3
の行までは yum update したときと同等の出力です。
kusanagi コマンドが最新の yum のパッケージに対応していないために panic を起こしているのではないかと推測しているのですがどうですかね？
