その後、

package-cleanup –cleandupes

を試したところ、アップデートはうまくいったのですが、アクセス解析がまだおかしかったので、conohaの管理画面でサーバーを再起動してみたところ、今後はサイトが落ちて、その後はサーバー自体にもつながらなくなってしまいました。

racut initqueue timeout

とかいうのが連発して、もはやsshでのログインすらできません。FTPからも入れないし、conohaのコンソールからも入れません。

バックアップはしてあったのですが、そのサーバー内に自動保存だったので、yumが動かない限り復元も不可です。
これはもしかしたらもうお手上げでしょうか？ ４年くらい続けていたサイトですのでショックすぎて逆に、冷静になってしまっているくらいです。最悪データだけでも生きてたら幸いなのですが、もうジエンドですかね・・